L'archevêque de Sens Guy de Noyers (1176-1193) décida de fonder un collège de chanoines à Saint-Julien-du-Sault (1184). L'initiative présida à la reconstruction de l'église paroissiale, dont la nef était à la charge des paroissiens et le sanctuaire à celle des chanoines. Les travaux durèrent fort longtemps ; d'ailleurs la nef n'a jamais été terminée. Nef et déambulatoire témoignent des campagnes menées à l'extrême fin du XIIe et au XIIIe siècle, huit verrières du déambulatoire datant du règne de saint Louis, notamment le vitrail de Saint-Jean-Baptiste et celui de saint Blaise. L'élégant portail nord de la collégiale date aussi du XIIIe siècle. C'est cependant à la fin du XVe et durant la première moitié du XVIe siècle que le sanctuaire fut édifié, dans un style gothique déjà Renaissance qui a notamment légué un important ensemble de vitraux, telle la verrière illustrant la légende de saint Julien. Les nombreuses inscriptions, au niveau des vitraux, ont été inventoriées.
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